ناتوانی یک پسر نوجوان خجالتی در نه گفتن زمانی آزمایش می شود که یک دختر سرسخت او را به سفری عرفانی در میان برف تابستانی می کشاند تا مادر گم شده اش را پیدا کند.

دو سال پس از نبردی سهمگین، قهرمانان ما با پسری دیدار می کنند که ادعا می‌کند اولین محافظ دنیای دیجیمون است. در همین حال دیجیمونی در دنیای واقعی ظاهر می‌شود که نقشه ای بزرگ در سر دارد و ...

داستان فیلم در شهر خرابه واقع در آینده نزدیک ژاپن، و دربارهٔ پسری جوان به نام کویو رانکین است که پس از شیوع بیماری آنفلوانزای سگ‌سانان و تبعید این گونه جانوری به یک جزیره، به دنبال سگ خود می‌گردد...